Para el mejor desempeño de sus funciones, la SECS está estructurada en Secciones siguiendo el modelo de la International Union of Soil Sciences (IUSS), siendo operativas las consignadas a continuación a las que se han adscrito al menos quince socios. En la Asamblea General celebrada el 19 de Febrero de 2021 fueron elegidos los siguientes cargos:
GEOGRAFÍA DE LOS SUELOS
Presidente: Jaume Porta Casanellas
Secretaria: Natalia Rodríguez Eugenio
GÉNESIS DE LOS SUELOS
Presidenta: Elvira Roquero
García-Casal
Secretaria: Pilar Carral González
CLASIFICACIÓN DE LOS SUELOS
Presidente: Jaume Boixadera Llobet
Secretario: Emilio Ascaso Sastrón
FÍSICA DEL SUELO
Presidenta: María Martínez-Mena García
Secretaria: María Almagro Bonmatí
QUÍMICA DEL SUELO
Presidenta: Emilia Fernández Ondoño
Secretaria: Layla Márquez San Emeterio
MINERALOGÍA DEL SUELO
Presidente: Manuel M. Jordán Vidal
Secretario: José Navarro Pedreño
BIOLOGÍA DEL SUELO
Presidenta: Montserrat Díaz Raviña
Secretario: David Fernández Calviño
EVALUACIÓN Y PLANIFICACIÓN DEL USO DEL SUELO
Presidente: Antonio Sánchez Navarro
Secretaria: Elvira Díaz Pereira
FERTILIDAD Y NUTRICIÓN DE PLANTAS
Presidente: Jesús Ángel Betrán Aso
Secretaria: Asunción Usón Murillo
CONTROL DE LA DEGRADACIÓN Y RECUPERACIÓN DE SUELOS
Presidente: Juan Luis Mora Hernández
Secretario: Nazaret González Alcaraz
CONSERVACIÓN DE SUELOS Y AGUAS
Presidente: Ramón Bienes Allas
Secretario: María José Marqués Pérez
SUELOS Y MEDIOAMBIENTE
Presidenta: M. Carmen Monterroso Martínez
Secretaria: Rocío Millán Gómez
CAMBIO DE USO DE SUELO
Presidente: Raimundo Jiménez Ballesta
Secretaria: Francisco Jesús García Navarro
ENSEÑANZA DEL SUELO Y CONCIENCIACIÓN CIUDADANA
Presidenta: Cristina Lull Noguera
Secretario: Luis Roca Pérez