Técnica biológica para a eliminação de organismos indesejados do solo proposto por J. A. Kirkegaard em 1993, que se aproveita da capacidade biocida de substâncias voláteis geradas pela decomposição de matéria orgânica fresca aplicada ao solo. Os restos frescos das brássicas, quando decompostos, emitem isotiocianato, um gás que tem uma ação biocida sobre nematóides; estrume fresco emite amônio; outras matérias orgânicas emitem fenóis. Esta técnica é uma alternativa aos métodos químicos de esterilização.

Para alcançar a fermentação da matéria orgânica abaixo da superfície do solo, é necessário: 1) incorporar uma quantidade significativa de matéria orgânica fresca (5 kg m^-2) de origem animal (estrume fresco de gado, estrume de frango ou chorume porcino) ou vegetal (resíduos agroindustriais; restos frescos da colheita anterior, no caso em que não estejem infestados; ou um adubo verde); 2) fornecer grandes quantidades de água de irrigação para que a matéria orgânica contenha água até cerca de -33 kPa, de modo que a lâmina de água cubra a superfície do solo e condições anaeróbicas sejam criadas; 3) revestimento com folhas plásticas (por exemplo, um filme de polietileno), para que os gases liberados fiquem presos; 4) esperar um período de tempo de várias semanas. Em solos de superfície arenosa, a camada de areia deve ser removida antes do tratamento.

A atividade inibitória dependerá da desativação térmica, da liberação de compostos biotóxicos voláteis, como amônio, metilisotiocianatos e outros compostos de enxofre, bem como compostos que estimulem antagonistas saprófitas do solo, como aldeídos, álcoois e/ou toxinas alelopáticas.

A biofumigação pode ser realizada em qualquer época do ano, pois não precisa atingir temperaturas muito altas, embora seja preciso levar em conta que o processo de degradação da matéria orgânica é mais rápido quando as temperaturas são altas.

É uma técnica mais eficaz quando combinada com o manejo integrado e as práticas agrícolas de rotação de culturas. É aplicável tanto em pequenas parcelas quanto em grande escala com máquinas. É economicamente viável para a maioria dos produtores.