Qualquer processo que usa células vivas enteiras (por exemplo, bactérias, fermentos) ou seus componentes (por exemplo, enzimas, organelas, etc.) para obter as alterações físicas ou químicas desejadas, ou que gere um determinado produto de valor agregado. A engenharia de bioprocessos é a biotecnologia.

Por exemplo, os bioprocessos são utilizados desde a produção de alimentos (incluindo a fabricação de alimentos) até o projeto térmico de edifícios, dispositivos biomédicos, controle de poluição, entre outros.