Carbono contido nas células dos microrganismos do solo (bactérias, fungos e arquéias), e se expressa como C_mic.

Entre os vários métodos para determiná-lo, vale mencionar: 1) método de fumigação-extração com clorofórmio; 2) método de respiração induzido por substrato (SIR), que permite determinar o carbono da biomassa da subpopulação de microrganismos metabólicamente ativos.