Técnica de fitorremediação que consiste na degradação ou inativação de contaminantes como resultado direto do metabolismo vegetal por enzimas presentes nos tecidos vegetais.

Pode ser usada para degradar contaminantes em corpos d’água. Por exemplo, em áreas úmidas que recebem efluentes de águas residuais, a cana comum Phragmites australis é usada, a qual pode absorver, translocar e degradar ibuprofeno presente na água; enquanto o junco Scyrpus grossus tem sido usado para a degradação do diesel em água contaminada.

Plantas transgênicas que expressam um gene bacteriano à partir de uma hidrolase de fósforo orgânico (OPH) podem segregar a enzima para o meio e fornecer uma nova estratégia de fitodegradação para compostos organofosforados usados como pesticidas.