Mecanismos de humificação da matéria orgânica pelos quais as substâncias húmicas são formadas, que é um dos aspectos menos compreendidos da química do húmus.

Na formação de substâncias húmicas, um conjunto de processos de transformação de resíduos orgânicos vegetais e animais são realizados essencialmente pela comunidade microbiana. Dão origem a complexos de moléculas orgânicas (principalmente baseadas em unidades fenólicas e alquil aromáticas) ligadas por diferentes tipos de ligações covalentes, mas também por pontes de hidrogênio, interações hidrofóbicas, forças de van der Waals, atração iônica e complexos de coordenação.

No avanço do conhecimento das substâncias húmicas, vários mecanismos têm sido propostos para explicar a estrutura e formação das mesmas durante os processos de decomposição da MOS: 1) teoria da lignina proposta por S. A. Waksman (1936); 2) teoria dos polifenóis; 3) teoria de W. Flaig. Essas três vias devem ser consideradas como possíveis mecanismos na natureza, embora não operem em solos diferentes na mesma extensão ou com a mesma importância.