Estratégia de fitorremediação in situ que se baseia no uso de raízes de plantas para absorver e concentrar metais tóxicos presentes no ambiente aquático (por exemplo, águas subterrâneas contaminadas, águas residuais).
Requerem-se plantas que têm um sistema radicular de crescimento rápido. Ao contrário de outras técnicas de fitorremediação, a rizofiltração utiliza plantas cultivadas hidroponicamente e quando o sistema radicular está bem desenvolvido, elas são transferidas para o local contaminado, para que as raízes absorvam os contaminantes dissolvidos na água. Quando as raízes ficam saturadas com o contaminante, as plantas são colhidas e processadas.
Resulta eficaz com baixas concentrações de metais tóxicos como cobre (Cu2+), cádmio (Cd2+), cromo (Cr6+), níquel (Ni2+), chumbo (Pb2+) e zinco (Zn2+) e grandes volumes de água.