Fenômeno natural pelo qual um organismo produz um ou mais compostos bioquímicos (aleloquímicos) que influenciam o crescimento, sobrevivência ou reprodução de outros organismos. Esses aleloquímicos podem ter efeitos benéficos (alelopatia positiva) ou prejudiciais (alelopatia negativa) nos organismos receptores.

Se estudam as interações químicas planta-planta (alelopatias) e planta-organismo não-vegetal (aleloquímicos).

Como exemplos de efeitos negativos se incluem: (1) inibição da germinação de espécies do sub-bosque pelas principais espécies de árvores; por exemplo, a atividade alelopática do eucalipto (Eucalyptus globulus Labill.) e pinheiro (Pinus pinaster Ait. e Pinus radiata D.) foi citada como sendo causada pela liberação de terpenos voláteis que inibem a germinação de outras espécies vegetais no sub-bosque; (2) a inibição exercida pela flora arvense na germinação ou desenvolvimento de plantas hortícolas; 3) o efeito alelopático das raízes das amêndoas (Prunus dulcis (Mill.) D. A. Webb) nas culturas subsequentes e por isso devem ser totalmente arrancadas antes de prosseguir para uma mudança de cultura, para evitar o efeito alelopático na cultura subsequente.

Os agentes alelopáticos são compostos polifenólicos (como taninos, flavonóides e uma variedade de outros polifenóis), cuja atividade dependerá de sua mobilidade na fase líquida do solo, e compostos terpenos. Plantas em climas úmidos são ricas em compostos fenólicos (solúveis em água), enquanto aquelas em climas secos são ricas em compostos terpenos (voláteis e não solúveis em água).
Os baixos índices de nitrificação em muitos solos florestais são considerados resultado da inibição alelopática da comunidade microbiana, embora outros fatores possam estar envolvidos. Por exemplo, taninos hidrolizáveis como ácidos gálico, elágico, trigálico, tetragálico e quebúlico estão presentes em solos florestais em concentrações suficientes para inibir a nitrificação. No caso de uma inibição alelopática da nitrificação, o nitrogênio permaneceria como N-NH₄ no solo e , portanto, a energia é conservada, uma vez que as plantas não podem tomar N-NO₃ sem gastar energia para reduzi-la ao N-NH₄; isso diminui o risco de perda de nitrogênio por percolação. O grau de inibição varia de uma espécie de coníferas para outra, pode estar sujeito a flutuações sazonais e depender do estágio de crescimento da floresta.