Carbono contido nas células dos microorganismos do solo (bacterias, fungos e arqueas), exprésase como C_mic.

Entre os diversos métodos para determinalo cabe indicar: 1) método da fumigación-extracción con cloroformo; 2) método de respiración inducida polo substrato (SIR), que permite determinar o carbono da biomasa da subpoboación de microorganismos metabolicamente activos.