Região da raiz em que os microrganismos vivem dentro dos tecidos (intra-tecidos) da raiz e neles dentro das células (intracelulares), sem serem parasitas ou predadores e que não induzem a formação de órgãos particulares reconhecíveis morfologicamente.

Os microorganismos podem ser encontrados no rizoplano, que corresponde à própria superfície do tecido radicular; na histosfera, que é a região intra-tecido, mas extracelular; ou na citosfera.