Conjunto de técnicas para reduzir ao mínimo populações de microrganismos nocivos que causam danos às raízes e, portanto, reduzem a produção das culturas.

Utilizam-se procedimentos menos agressivos do que aqueles que são utilizados na esterilização total, para que não prejudiquem a atividade de organismos benéficos. Tem a desvantagem de permitir que organismos indesejados sobrevivam, mas muito competitivos e resistentes.

Métodos físicos e métodos químicos podem ser utilizados, aplicados com menor intensidade do que no caso de esterilização total. Por exemplo, injetar ar e vapor de água quente sob pressão, ao nível da superfície ou injetá-lo a uma profundidade de 60 cm criando pressões negativas; ou com solarização, biossolarização ou biofumigação.