Factores que inflúen positiva ou negativamente na actividade dos microorganismos do solo: 1) condicións ambientais: humidade (estrés hídrico debido á seca ou ben a un exceso de auga); aeración (niveis de osíxeno); temperaturas extremas; 2) propiedades do solo: valor do pH, porosidade; 3) prácticas agrícolas: rega, aplicación de fertilizantes, materia orgánica ou emendas calcarias, rotación de cultivos, entre outras.

Depende da fase do ciclo biolóxico no que se atopen os microorganismos, que poden supoñer formas de resistencia como esporas, esclerocios, quistes, minicélulas, entre outras.