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Conjunto de organismos tanto animais como protistas (protozoários) que desenvolvem todo ou parte de seu ciclo de vida no solo. Inclui grupos taxonômicos muito diversos: platelmintos, nematóides, rotíferos, tardígrados, anelídeos, moluscos, artrópodes e vertebrados.

Classifica-se de acordo com: 1) tamanho corporal (diâmetro): microfauna, mesofauna, macrofauna e megafauna; 2) distribuição vertical, por exemplo, epígeos e hipógeos; 3) comportamento trófico (bacterívoros, fungos, detritívoros, etc); 4) papel ecológico (fragmentadores, engenheiros do ecossistema, etc.); 5) outros: biogeografia, atividade enzimática em seu sistema digestivo, estratégia reprodutiva.