Processo metabólico redox que ocorre na ausência de oxigénio, isto é, em condições anaeróbicas, por meio do qual um substrato orgânico se transforma em produtos cujo grau de oxidação médio é o mesmo que o dos reagentes iniciais, atuando simultaneamente como dador e recetor de eletrões. A energia produzida é muito menor do que na respiração. A fermentação da matéria orgânica pode levar à formação de produtos com efeitos fitotóxicos, tais como o ácido acético, que é mais tóxico a valores baixos de pH, já que nesta situação é lipofílico e solúvel nos componentes lipídicos das membranas das raízes das plantas. Também pode produzir emissão de biogases com efeito estufa, como o metano (CH₄). As fermentações industriais controladas (alcoólica, lática, acética, butírica) têm múltiplas aplicações na indústria agro-alimentar (p.e., na elaboração de vinho, cerveja e queijos).