Entre as diversas funcións dos fungos do solo cabe destacar: 1) o papel como descompoñedores da materia orgánica, desde os azucres máis simples e aminoácidos aos polímeros resistentes como a lignina e os ácidos húmicos complexos; 2) a formación de micorrizas, ao asociarse simbioticamente coas raíces; 3) a formación de liques, ao asociarse simbioticamente cunha alga; 4) a degradación e retención de contaminantes (micorremediación).