Interacción entre dúas especies nas que ambas se benefician. Moitas relacións entre fungos e raíces de plantas son mutualistas. No caso dos protozoos flaxelados intestinais e os térmites é un mutualismo obrigado, xa que ningún dos dous pode sobrevivir en condicións naturais sen o outro. Inclúe a simbiose e a sintrofia.