Processo biológico de formação de nitratos, geralmente por oxidação biológica do ião amónio em condições de bom arejamento do solo. Consiste em duas etapas – na primeira o amónio transforma-se em iões nitrito, pela intervenção de bactérias do género Nitrosomonas), e na segunda os iões nitrito convertem-se em nitrato, por intervenção de bactérias do género Nitrobacter). Este tipo de nitrificação, denominada autotrófica, é a que predomina em solos neutros ou alcalinos. Também se podem formar nitratos em apenas uma etapa, directamente a partir do ião amónio.