Rama da ecoloxía que estuda as interaccións entre os organismos e poboacións que viven nun determinado ecosistema, cos factores bióticos e abióticos. Ocúpase principalmente das transferencias de materia e enerxía entre os compoñentes do ecosistema.
Diferénciase de autoecoloxía, que se refire á ecoloxía de organismos e poboacións individuais.